本子栏目“医药研发标准参照物”收集了药物研发过程中发现和证明了具有生物活性的小分子化合物，包括处于临床阶段的新化合物、未通过临床试验但是证明其对某种靶点具有某种活性的化合物、科学文献中报道的具有某种特定的生物活性的化合物。已经面市的化学药物、天然产物药物等收集在“医药、代谢物与杂质标准参照物”栏目下的对应子栏目中。